重大突破:非天然碱基在活细胞中编码蛋白质!
11月29日,《Nature》在线发表了题为“A semi-syntheticorganism that stores and retrieves increased genetic information”的研究论文,来自美国的Romesberg团队通过扩展基因编码,在培养的细菌中增加了一对人造碱基对,首次实现非天然碱基在活细胞中编码蛋白质。
研究人员将非天然碱基植入大肠杆菌的基因组中,并通过转录、翻译非天然氨基酸,合成绿色荧光蛋白质,且这种新的氨基酸并未改变绿色荧光蛋白质的形状或功能。
非天然碱基制造出绿色荧光蛋白质
早在2014 年,Romesberg 等人就构建出了一种包含了两种人造核苷酸(dNaM和d5SICS)的半合成菌株,首次成功实现人造碱基对的体内复制。但该研究中,外来DNA严重阻碍了细胞的生长,且这种人工碱基对还不能像正常DNA一样编码蛋白质。
人造碱基的体内复制成功激发了人们的无限遐想:怎么才能减少排斥作用?有没有可能添加更多碱基?能不能用这些碱基创造出更复杂的生物?
今年早些时候,该团队在PNAS发文,用dTPT3替换d5SICS,降低了细菌对新DNA碱基的排斥作用,但该菌株依然无法利用新密码子编码蛋白质。
新型碱基与自然碱基A-T结构比较图
11月29日,在前期的研究基础上,研究人员终于突破最后的瓶颈,通过改良tRNA,识别新的DNA碱基,并将两种全新的氨基酸PrK和pAzF运输到核糖体中,成功实现了非天然碱基的体内翻译。
改良后的tRNA
最终结果表明,在不影响正常生长的情况下,细菌实现了非天然核苷酸的转录和翻译(效率和天然核苷酸一样),从而合成包含非天然氨基酸的蛋白质。这也是人类首次证明,非天然碱基能在活细胞中编码蛋白质。
原有的ATCG四种碱基,编码64种密码子,定义20种氨基酸;而如今六种碱基,可以使DNA计算机从4进制升为6进制,这将大大增加可能的密码子的数量,理论上可以给予细胞利用超过 100 个额外氨基酸的能力。