生化不分家——寡核苷酸化学修饰的应用
在前期推送里,我们已经给大家分享了寡核苷酸的荧光基团、淬灭基团修饰,间臂类修饰和特殊碱基修饰。本文是寡核苷酸修饰系列的最后一篇,将给大家分享寡核苷酸化学修饰的应用。以下为一个简略版的表格,具体的例子与结构我们文章里见。
在前期推送里,我们已经给大家分享了寡核苷酸的荧光基团、淬灭基团修饰,间臂类修饰和特殊碱基修饰。本文是寡核苷酸修饰系列的最后一篇,将给大家分享寡核苷酸化学修饰的应用。以下为一个简略版的表格,具体的例子与结构我们文章里见。
前两期我们分享了寡核苷酸的荧光基团、淬灭基团修饰,以及间臂类修饰。本期推送将和大家分享寡核苷酸中特殊核苷酸的作用。在常见的A、T、G、C、U基础上,仅仅做了一点改变,或是某个原子的取代,或是某个基团的添加和缺失,但是却给寡核苷酸性质带来比较大的变化,赋予寡核苷酸新的功能。
腺相关病毒(AAV)是目前应用最为广泛且最为重要的体内基因治疗载体。它们可以传递高达4.7 kb的遗传负载,并能感染广泛的细胞类型,而且几乎没有致病性。AAV的生产过程以构建质粒为起始,到包装成病毒颗粒结束(图1)。由于AAV基因组的结构特征,制备具有高保真DNA的AAV病毒是很困难的。基于此,安升达提供一站式的AAV基因组测序质检方案,优化AAV载体的质量。
近年来,嵌合抗原受体T(chimeric antigen receptor T,CAR-T)细胞疗法因在血液肿瘤中的突出疗效已成为肿瘤细胞免疫治疗领域中新的研发热点。但是该疗法所使用的慢病毒载体介导的基因转导可能存在一定的潜在风险:慢病毒在细胞基因组的整合可能引起原癌基因的激活、抑癌基因的失活、RNA 剪接、基因融合等,从而具有成瘤风险。根据国家药品监督管理局药品审批中心(CDE)发布的《基因修饰细胞治疗产品非临床研究与技术指导原则》,慢病毒外源序列在基因组的整合位点及安全风险评估是CDE放行的重要因素。
提到寡核苷酸的spacer修饰,很多小伙伴可能比较陌生,它们不像荧光、硫代、biotin修饰等赋予寡核苷酸显而易见的特点;但是在许多生物、化学应用中,使用合适的spacer,会帮助我们收获更漂亮的结果。本文将给大家分享常见的spacer种类与应用实例,让我们共同学习、探讨spacer的使用。
上一次的专题中,我们罗列了学术界几类主流的CRISPR脱靶检测方法,它们原理各不相同,能够找到的脱靶位点也有所区别。在实际应用中,如何选择CRISPR脱靶检测方法,如何选择用于检测的细胞,发现脱靶位点后又如何进行评估,都是需要重点关注的问题。接下来,我们将以几个前沿的CRISPR临床实验为例,阐述一下CRISPR临床实验中的脱靶风险评估策略。
自1985年提出人类基因组计划,并取得突破性进展后,测序技术对于基因组的研究逐渐成为一种必不可少的手段。测序技术的不断更新,也为基因组研究提供了有利保障。一代测序虽然具有长读长、精确度高等优势,但由于测序通量低导致无法进行大规模测序。二代测序通量高且测序时间短,能够快速高效的进行基因组测序,但由于读长过短、PCR扩增错误、GC偏好性等缺点,虽然能拼接出基因组,但很难拼接到染色体水平。而三代测序的出现,基于单分子测序技术,且无需PCR扩增,避免了PCR扩增引入的错误,因此对于基因组测序而言,同时具有了高通量、高效率、长读长的优势,可以使越来越多的物种组装出高质量的基因组
微孔板作为一种便捷的样品存储、运输、反应的实验耗材,在实验室中非常常见,但其在密封处理中经常存在密封不严的困扰,导致样品蒸发、溢漏或污染。因此为微孔板选择正确的微孔板密封膜对于得到最佳的实验室结果并避免在下游进行不必要的工作非常重要。热密封提供了一种 100%有效的孔板密封方法,可实现完全的密封,使用快速且经济高效。今天我们将分享两种使用热密封技术的膜。
基因的功能研究一直是生物学研究的核心,建立合适的遗传筛选体系,是基因功能研究的最佳手段。最早的辐射和化学诱变就是经典的正向遗传学方法,基于表型筛选出基因组上的随机突变,寻找表型和基因的联系。基因诱变法在生物学研究的初期帮助我们解析了很多基因的功能,但是表型筛选的工作量巨大,还需要进行繁琐的杂交实验来确定基因位置和序列,在生物学研究逐步进入基因组学时代后,正向遗传学方法逐渐被淘汰。
从古至今,人们都喜欢用各种装饰、服装、化妆品把自己变得美美的。现代人也有见朋友的“最高礼仪”:洗个头,化全妆等等。
化妆能提升个人气质,而引物也可以通过各类修饰获得更多特性。今天这篇,我们就先看看荧光和淬灭修饰基团对引物的作用吧。
荧光染料